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    Cell:全面解析大規模癌癥基因組
    來(lái)源:生物通 | 作者:和諾 | 發(fā)布時(shí)間: 2014-11-04 | 1059 次瀏覽 | 分享到:

        來(lái)自癌癥基因組圖譜研究網(wǎng)絡(luò )( The  Cancer  Genome  Atlas  Research  Network, TCGA )的研究人員針對甲狀腺癌( thyroid  cancer )進(jìn)行了綜合分析,鑒別出了一些侵襲性腫瘤的標記物,這有可能為給予個(gè)別患者適當的治療方法提供了更好的靶點(diǎn)。

     

    研究結果表明,有可能可以基于一些遺傳標記物將這一疾病進(jìn)行重新分類(lèi),推動(dòng)甲狀腺癌更多地受益于精準施藥。

     

    “對于甲狀腺癌基因組景觀(guān)的這一認識將改進(jìn)它的分類(lèi),改善分子診斷。這將幫助我們將那些需要積極治療的患者與腫瘤不太可能會(huì )生長(cháng)或擴散的患者區分開(kāi)來(lái),”密歇根大學(xué)醫學(xué)院病理學(xué)教授 Thomas  J.  Giordano 博士說(shuō)。

     

    在過(guò)去的30年里甲狀腺癌的發(fā)病率提高了3倍,它是美國最快速增長(cháng)的癌癥。盡管這些腫瘤通常生長(cháng)緩慢,且結合手術(shù)、甲狀腺激素和放射性碘很容易進(jìn)行治療,一些患者將會(huì )形成更為侵襲性和致命性的甲狀腺癌。

     

    在這一發(fā)表在《細胞》(Cell)雜志上的文章中,研究人員分析了近500個(gè)甲狀腺癌樣本,鑒別出了所有起作用的遺傳突變。他們發(fā)現了一些新的癌基因以及現有基因的一些新變異。


    研究人員發(fā)現,總的來(lái)說(shuō),甲狀腺基因組相對平靜,相比于其他常見(jiàn)的癌癥相關(guān)遺傳突變要少一些。這或許可以解釋為什么這一疾病通常會(huì )生長(cháng)緩慢。

     

    更少的突變意味著(zhù),研究人員能夠檢測相關(guān)的一些信號通路,了解是什么驅動(dòng)了甲狀腺癌。這種方法幫助了他們了解更多甲狀腺癌的遺傳驅動(dòng)因子,將“暗物質(zhì)”案例(攜帶未知遺傳驅動(dòng)因子的癌癥)比例從25%降到了3.5%。

     

    這些驅動(dòng)因子可以分為兩個(gè)主要的致癌組:BRAF加相似的突變,以及RAS加相似的突變。但在這兩組內,尤其是BRAF組中,存在幾個(gè)不同的甲狀腺癌亞型。當前,所有與BRAF相關(guān)的甲狀腺癌都被認為基本上是一樣的。事實(shí)并非如此。

     

    Broad研究所癌癥基因組計算部主任 Gad  Getz 說(shuō):“這項研究整合了各種各樣的基因組數據,不僅鑒別了癌癥驅動(dòng)因子,還比較了這些不同驅動(dòng)因子的行為。有趣的是,我們發(fā)現一些BRAF突變甲狀腺癌亞型是通過(guò)不同的機制來(lái)驅動(dòng)癌癥,其中一些亞型與更高風(fēng)險、低分化的癌癥相關(guān)?!?/span>

     

    研究人員利用這一認識建立了測度或評分,可以確定一個(gè)腫瘤如何發(fā)生信號以及它的侵襲性。研究人員在一項臨床試驗中測試了這些評分,以評估是否可促成更具針對性地治療建議。

     

    國立人類(lèi)基因組研究所基因組醫學(xué)部項目主任 Carolyn  Hutter 博士說(shuō):“這些研究結果意味著(zhù)醫生和患者將在處理癌癥診斷和治療方面邁出重要的一步。世界各地的研究人員將利用這一數據,返回到數據中來(lái),提出其他的一些科學(xué)問(wèn)題?!?/span>

     

    對于病理學(xué)和科學(xué)群體初步的建議是,考慮基于分子亞型對甲狀腺癌進(jìn)行重新分類(lèi),以更好地反映它們的潛在分子特性。這將使得醫生能夠將緩慢生長(cháng)的腫瘤與侵襲性腫瘤區分開(kāi)來(lái),推薦適當的治療。

     

    癌癥基因組圖譜是一個(gè)得到聯(lián)邦政府資助的項目,旨在了解各種癌癥類(lèi)型的分子特征。這一項目已經(jīng)發(fā)表了一些癌癥類(lèi)型,如乳腺癌、結腸癌、卵巢癌和肺癌的許多標志性論文。甲狀腺癌是納入最大樣本量的研究之一,研究了近500個(gè)腫瘤。

     

    參考文獻:

     

    http://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(14)01238-0

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