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    下一代測序:癌癥個(gè)性化治療的核心
    來(lái)源:生物探索 | 作者:和諾 | 發(fā)布時(shí)間: 2014-11-04 | 1128 次瀏覽 | 分享到:

    毫無(wú)疑問(wèn),未來(lái)的癌癥治療將會(huì )根據患者特異性的生物標志物變得越來(lái)越個(gè)性化。在實(shí)現癌癥個(gè)性化治療的道路上,下一代測序(NGS)技術(shù)發(fā)揮著(zhù)不可取代的作用。在過(guò)去的幾年里,NGS變得更加精確,它幫助研究人員和病理學(xué)家實(shí)現了從單基因檢測到多基因檢測的完美轉換。

     

    NGS通過(guò)廣泛的基因篩查,預測癌癥的發(fā)病風(fēng)險,幫助醫生確定癌癥不同亞型的特異性療法。從另一方面來(lái)說(shuō),NGS通過(guò)解碼不同癌癥的基因變異信息,為醫生更好的理解癌癥的發(fā)病機制提供了很大的幫助。在了解患者遺傳學(xué)信息的基礎上,他們可以從多種癌癥療法中選擇對病人最佳的治療方案。

     

    德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心分子診斷部門(mén)主任 Rajyalakshmi  Luthra 博士說(shuō):“如今,大多數的分子診斷實(shí)驗室都在通過(guò)測序技術(shù)尋找與各種疾病相關(guān)的基因或其它標志物。我們知道每個(gè)癌癥類(lèi)型都可能有多個(gè)分子標記,為了更好的進(jìn)行靶向治療,我們不得不尋找更多的靶標?!?/span>

     

    NGS在癌癥治療中的現狀

     

    雖然NGS技術(shù)在近些年取得了巨大的進(jìn)步,但是它依然是一個(gè)相對昂貴的技術(shù)。盡管目前測幾百個(gè)基因的成本可能只相當于五年前測單個(gè)基因的成本,但是每次檢測的平均成本依然在2500-5000美元之間。出于這樣的原因,NGS的發(fā)展大部分依然局限在大型的學(xué)術(shù)醫療中心和診斷公司的實(shí)驗室中。

     

    臨床診斷公司 BioReference  Laboratories 的研發(fā)主任 Robert  Daber 表示,NGS的應用仍處于初級階段,要想在使NGS使用更加廣泛,我們必須做到以下兩點(diǎn):第一,它需要覆蓋更多與臨床相關(guān)的可控突變;第二,它需要使成本更加“親民”,且具有實(shí)際的檢測效果。

     

    Luthra博士說(shuō):“三年前MD安德森癌癥中心開(kāi)始使用NGS技術(shù),我們的目標是從分子水平對腫瘤進(jìn)行分析,為臨床醫生治療病人提供特異性標志物。然而,我們得到的腫瘤樣本的數量其實(shí)非常有限,因此,我們不能像以前做試驗一樣一次只檢測一個(gè)標志物?!?/span>

     

    “其實(shí),除了與臨床相關(guān)的標志物,那些目前被鑒定為與臨床無(wú)關(guān)的突變也一樣重要?!盌aber博士說(shuō),“可能有些突變只在極少數腫瘤(1%或1.5%)中被發(fā)現,但問(wèn)題是,這些獨特的突變究竟會(huì )影響癌癥的發(fā)展,還是與不含這種突變的患者相差無(wú)幾。目前,我們也沒(méi)有明確的答案?!?/span>

     下一代測序:癌癥個(gè)性化治療的核心


    NGS的局限性

     

    因為NGS仍是一個(gè)非常新鮮的技術(shù),儀器公司一直在不斷尋找改善NGS檢測方法以及他們提供的數據和信息工具的途徑。這也是很多機構不想在他們的實(shí)驗室開(kāi)展NGS的原因,不斷更新的成本實(shí)在太大了。

     

    Luthra博士說(shuō):“廠(chǎng)商總是在不斷努力改善他們的硬件和軟件,當然,這也是合情合理的。任何一個(gè)新的有前途的技術(shù)都需要不斷的進(jìn)步。然而,在臨床實(shí)驗室中,你不可能總是回頭驗證之前的結果是否正確。在一些小型或中等規模的實(shí)驗室,他們也不可能收集到足夠的樣本來(lái)重復驗證?!?/span>

     

    另一個(gè)在未來(lái)需要解決的限制因素是,腫瘤學(xué)家的遺傳學(xué)素養應該進(jìn)一步提高。美國阿拉巴馬大學(xué)基因組科學(xué)Heflin中心的主任 Bruce  Korf 博士說(shuō):“在基因組時(shí)代到來(lái)之前,臨床醫生需要進(jìn)行大量的遺傳學(xué)信息的學(xué)習,只有真正了解了基因組在疾病發(fā)生中扮演的角色,才能在實(shí)踐中利用好它們?!?/span>

     下一代測序:癌癥個(gè)性化治療的核心


    NGS在癌癥治療中的展望

     

    當然,依據NGS技術(shù)完成臨床決策還為時(shí)尚早,但是學(xué)術(shù)醫療中心和診斷公司每天積累的數據是進(jìn)一步解開(kāi)疾病秘密的關(guān)鍵。Daber博士說(shuō):“NGS讓我們了解了如此多的基因,接下來(lái)我們真正需要做的是整理這些重要標志物的信息(包括檢測方法、致病機理等),IT技術(shù)也可以為我們所用?!?/span>

     

    Luthra博士補充說(shuō):“隨著(zhù)越來(lái)越多的標志物被鑒定出來(lái),醫生可以判斷是否需要對患者進(jìn)行多基因檢測。商家可以先提供具有針對性的檢測服務(wù)供一些小型的醫院選擇。如果醫院需要更多的病人基因組信息,他們再選擇更全面的檢測項目。這樣一來(lái),NGS技術(shù)會(huì )進(jìn)入更多的醫院?!?/span>

     

    盡管實(shí)現這一愿望可能需要好多年,但是Luthra博士依然相信,隨著(zhù)大數據的發(fā)展和進(jìn)步,NGS技術(shù)必將為癌癥個(gè)性化治療提供更多的遺傳信息依據,也會(huì )成為醫院疾病診治的有效媒介。

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